Pubmed文献下载跟NCBI杠上了
Pubmed文献下载跟NCBI杠上了
本文核心词:自动化,爬虫,selenium,文献下载,pubmed
Pubmed,对于一个医学生来说应该都不陌生。它是一个生物医学相关的文献检索神器,医学相关的文献基本都能搜到。但是,但我们需要下载其中的文献时,或多或少都会有些问题。
其一、pubmed中的文献大多数并不能免费获取,搜索结果中只有少部分文献提供免费下载网址。其二、当需求是下载某主题相关的大量文献时,手动下载及其麻烦。

BRCA搜索结果
针对上述问题,采用以下思路:解决方法一、sci-hub。这是一个旨在打破知识壁垒项目,可以在其网址输入检索文献链接、pmid、doi获取免费文献,对我这种穷酸学生非常实用。解决方法二、selenium模拟点击下载文献。对,又是它!!!我觉得selenium实在是太强大了,尤其是对我这种懒人来说。
下面是思路:
通过
如上所述,构建
下一步则是用selenium操作浏览器,模拟点击。这里我采用了chrome浏览器,因为下载文献会有下载弹框,而配置firefox时总是出问题,chrome就简单的多。
